分类和系统发育

       坦噶尼喀湖的慈鲷最初在19世纪末成为科学研究的对象。当时最重要的分类学家是Boulenger，他根据Moore、Lemaire和Cunnington的采集，描述了许多新物种。在1909年至1916年期间，Boulenger出版了他四卷本的《非洲淡水鱼类目录》，其中提到了超过75种坦噶尼喀慈鲷，几乎全部由他描述。

       除了Boulenger和其他著名的鱼类学家如Pellegrin和Steindachner，他们每人都描述了少数坦噶尼喀慈鲷，对这些鱼类分类学的另一个主要贡献来自Poll，他单独或合著描述了超过65种慈鲷和几次修订，并于1956年发表了一份非常详尽的关于湖中慈鲷的考察报告，至今仍被视为这些鱼类的权威出版物。

       在他最后的修订中，Poll（1986年）将密切相关的属分为12个族，其中大多数仍被分类学家使用。Poll最初的族群分组包括Tilapiini、Haplochromini、Tylochromini、Lamprologini、Tropheini、Eretmodini、Ectodini、Trematocarini、Bathybatini、Limnochromini、Cyprichromini和Perissodini。Takahashi（2003a）修订了Poll的分类，将Gnathochromis pfefferi从Limnochromini转移到Tropheini，将Cyphotilapia frontosa从Tropheini中移除，将Boulengerochromis microlepis置于其自己的族——Boulengerochromini，并引入了两个新的族，Benthochromini和Cyphotilapiini。Takahashi还建议将Ctenochromis（现为Trematochromis，见下文）benthicola从Haplochromini转移到自己的族，但未为后者建议名称；Muschick等人（2012年）随后将该物种与Cyphotilapia一起归入Cyphotilapiini。Dunz & Schliewen（2013年）修订了Tilapiini，而之前在该族的唯一坦噶尼喀物种Oreochromis tanganicae现在被分配到Oreochromini。Meyer等人（2015年）将Tropheini与Haplochromini合并，目前的结果是坦噶尼喀湖慈鲷共有14个族。

       目前接受的14个族主要是通过评估形态学和行为特征建立的，除了极少数变化外，后来通过分子分析得到了确认。以下列表列出了这些族（从最古老到最年轻）及其包含的属（括号内的数字为包含的物种数量）：
- Tylochromini，1个属：Tylochromis（1）
- Oreochromini，1个属：Oreochromis（1）
- Bathybatini，2个属：Bathybates（7）和Hemibates（2）
- Trematocarini，1个属：Trematocara（9）
- Boulengerochromini，1个属：Boulengerochromis（1）
- Lamprologini，8个属：Altolamprologus（3）、Chalinochromis（4）、Julidochromis（5）、'Lamprologus'（15）、Lepidiolamprologus（10）、Neolamprologus（37）、Telmatochromis（9）和Variabilichromis（1）
- Benthochromini，1个属：Benthochromis（3）
- Perissodini，3个属：Haplotaxodon（1）、Perissodus（6）和Xenochromis（1）
- Cyprichromini，2个属：Cyprichromis（9）和Paracyprichromis（2）
- Cyphotilapiini，2个属：Cyphotilapia（1）和Trematochromis（1）
- Limnochromini，7个属：Baileychromis（1）、Gnathochromis（1）、Greenwoodochromis（4）、Limnochromis（1）、Reganochromis（1）、Tangachromis（1）和Triglachromis（1）
- Ectodini，13个属：Asprotilapia（1）、Aulonocranus（1）、Callochromis（4）、Cardiopharynx（2）、Cunningtonia（1）、Cyathopharynx（2）、Ectodus（2）、Enantiopus（2）、Grammatotria（1）、Lestradea（1）、Microdontochromis（2）、Ophthalmotilapia（5）和Xenotilapia（15）
- Eretmodini，3个属：Eretmodus（2）、Spathodus（2）和Tanganicodus（1）
- Haplochromini，9个属：Ctenochromis（1）、'Gnathochromis'（1）、Interochromis（1）、Limnotilapia（1）、Lobochilotes（1）、Petrochromis（12）、Pseudosimochromis（4）、Simochromis（1）和Tropheus（9）。